21世纪初(chū )，人类将多数人(rén )留在被哥斯拉蹂躏的地球上，仅使被选中的人们乘上恒(🧟)星间(jiān )移(yí )民船·(🌮)阿拉特(tè )拉姆，前往能够移(yí )居(jū )(👊)的“约定之地·τ星(xīng )(🏻)e”。但这一(🥋)计(jì )(🤷)划(huá )失败，人(🚶)类(lèi )只得(🐩)再度返回地球。而(ér )长距离(lí )(📧)亚(🔍)空间航行所引(👌)发的时空歪(wāi )(👵)曲，导致人类回到的地方变成了“两万年后的地球”。在这个(gè )地球，主人公(😳)·(👗)晴男等(děng )人在遭受(shòu )(👚)哥(🛃)斯拉袭击的同时(shí )，与埃克西(😉)弗(fú )、比尔(ěr )沙尔德两种(zhǒng )族(🧥)的异星(xīng )人共(🔬)同实行谋划了20年(nián )的“对哥(🐅)斯拉战术”，通过(🛌)殊死(🕵)战斗成功击倒(dǎo )了哥斯拉。　　但喜悦(🙎)并未持续(xù )多久，深藏地下的真正哥(gē )斯拉“哥斯拉·地球”现身了(💱)。两万(wàn )年(nián )间持(👌)续成(chéng )长生(shēng )存、身高(gāo )(🏌)300米、质量(liàng )超过10万(wàn )(🍄)吨，在进化成(🥏)这(zhè )种(zhǒng )姿态的超巨(jù )大哥(gē )斯拉压(yā )倒(😀)性的(de )破坏力(lì )面(✝)前，晴男等(🕎)人落花(huā )(🤼)流水。　　拯救(jiù )了(le )晴男的是(shì )(🛴)被视为人类(lèi )的残存者“弗图亚”之(😯)民，米亚娜(😫)。弗(fú )图亚是(🛹)他们在这个地(dì )球首(🍵)次遇(🌨)到的人(🎓)型生(shēng )命种族(❤)。他(tā )们会(⚡)是(shì )人类(🍁)的子(zǐ )孙吗(🧛)——(📚)。“弗图亚(yà )的(✒)神也被哥(gē )斯拉击破，如(📈)今只剩下卵。挑(🖐)战(📎)者、抗(kàng )争者，全部被(👽)火焰吞(Ⓜ)噬而(🚴)消失了(le )”面对这(zhè )样(🖖)的他们，晴(qíng )男(nán )回应道“这是以(🍯)人类(🌳)的(de )双手(shǒu )夺回地球的最后(hòu )机会了”。　(🕦)　另一方面，比尔(ěr )沙尔(ěr )德的指(🐃)挥官·加尔格(💨)，注(🛳)意(yì )到弗图亚使用的箭头是由“自律思(🏢)考金(📖)属(🔜)体·纳米金属”所(👜)制造(🎮)而欢喜。这和21世纪他们在(zài )富士山(🎾)麓(🈸)作为(📪)“对哥(🍨)斯拉决战兵(🤗)器”所开发、在(🥇)启动(😜)前遭到破坏(🏩)的(de )(🌔)“机械(xiè )哥斯拉(lā )”由(🏋)同种物(wù )(😒)质(zhì )所构成(chéng )。这正是(🍑)当时的(de )开发设(shè )备至今(😂)仍(réng )然残(🐢)存的证(zhèng )明——。